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産総研の本部組織一覧です。
| 組織 | 連絡先 | 所在地 | |
| 企画本部 | 代表電話：03-5501-0830（東京） 総合案内：029-861-2000（つくば） 受付時間：月〜金 8：30〜17：30（祝日を除く） |
東京本部・つくば | |
| コンプライアンス推進本部 | 代表電話：029-862-6834 | つくば | |
| イノベーション推進本部 | イノベーション推進企画部 | 代表電話：029-862-6040 | |
| 知的財産部 | 代表電話：029-862-6153 | ||
| 産学官連携推進部 | 代表電話：029-862-6144 | ||
| 国際部 | 代表電話：029-862-6244 | ||
| ベンチャー開発部 | 代表電話：029-862-6655 | ||
| 国際標準推進部 | 代表電話：029-862-6221 | ||
| イノベーションスクール | 代表電話：029-862-6084 | ||
| つくばイノベーションアリーナ推進本部 | つくばイノベーションアリーナ企画室 | 代表電話： | |
| つくばイノベーションアリーナ連携推進室 | 代表電話： | ||
| 共用施設調整室 | 代表電話： | ||
| スーパークリーンルーム運営室 | 代表電話： | ||
| 研究環境安全本部 | 研究環境安全企画部 | 代表電話：029-861-2121 | |
| 環境安全管理部 | 代表電話：029-861-2124 | ||
| 研究環境整備部 | 代表電話：029-861-2141 | ||
| 情報環境基盤部 | 代表電話：029-861-2077 | ||
| 総務本部 | 業務推進支援部 | 代表電話：029-861-2067 | |
| 人事部 | 代表電話：029-862-6284 | ||
| 財務部 | 代表電話：029-862-6309 | ||
| ダイバーシティ推進室 | 代表電話：029-862-6418 | ||
| 評価部 | 代表電話：029-862-6096〜99 | ||
| 広報部 | 代表電話：029-862-6211 | ||
