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産学官を問わず、あらゆる分野の研究者の積極的参加のもと集中共同研究を推進する。
研究のテーマの内容や研究の進捗度に即応して、研究者が機動的に参加できるよう任期を限った体制をとっている。研究テーマが終了すればグループは解散し、それぞれの出身研究機関に戻っていく。
海外の研究者も研究に容易に参加し、また国際ワークショップの開催や研究成果の公表を積極的に行い、国際的な情報創造・発信を行う。
各研究テーマにそれぞれ設置された評価委員会と、融合研全体としての運営について審議する評議員会の意見を取り入れ、公正に評価する体制をとっている。
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